虽然三代试管婴儿会对胚胎染色体基因进行筛查，但是目前三代试管婴儿可以筛查的疾病只有274种，而全球已知的遗传病超3000种，所以并不是所有疾病三代试管婴儿都是筛查排除掉的。为了保证三代试管婴儿成功率以及胎儿出生健康，医院都是要求夫妻双方在三代试管婴儿前查染色体，判断是否能通过三代试管婴儿技术排除该疾病。
在女性不孕不育的主要原因中，除了子宫疾病、子宫内膜等原因，染色体异常几乎占据了主导地位。尤其是超过37岁的女性中，胚胎存在染色体非整倍体问题的接近80%，超过42岁的女性，概率高于90%。
胚胎染色体异常，不仅会导致胚胎无法着床，浪费移植的激活，即使着床，胎儿患病的可能性也非常高；据大数据显示，夫妻双方年龄越大，发生染色体异常的概率就越高，而通过三代试管婴儿胚胎筛查技术，可以将染色体异常的胚胎筛查出来，提高胚胎着床率，以此提高妊娠几率。
做三代试管婴儿是需要适应症的，只有染色体异常、存在遗传病史、多次种植失败的情况才能进行三代试管婴儿助孕，而助孕前需要孩子双方提供相关检查报告表面存在适应症才行，否则只能做一代、二代试管婴儿。目前三代试管婴儿技术可以筛查的疾病是有限的，绝大部分遗传病通过三代试管婴儿是无法排除的，所以需要夫妻双方先进行染色体检查，明确是否能进行三代试管婴儿治疗。
虽然说三代试管婴儿会对胚胎进行基因筛查，但是由于国家政策，三代试管婴儿技术局限以及优生优育目的等原因，都是需要夫妻双方进行染色体检查后才能开展三代试管婴儿进行助孕。
