三代试管确实容易出现嵌合体，这主要是和染色体丢失、细胞分裂后延迟、激素水平紊乱等有关系，第三代试管可以对胚胎进行基因检查，排出可能导致疾病的基因，但这种筛查并不能完全保证胚胎的健康，可能有一种特殊情况，即嵌合体胚胎，而嵌合体胚胎通常可能导致一些先天性疾病。
胚胎嵌合体在第三代试管婴儿当中还是比较常见的，出现的概率大概是在15%-90%之间，使其出现的原因通常和以下因素有关：
1、染色体丢失：胚胎进入子宫后，会受到子宫环境的影响，在植入和分裂的过程中，一些染色体可能会丢失，然后继续发育的胚胎可能会出现嵌合体的情况；
2、细胞分裂后延迟：一些细胞的染色体出现复制错误，这种错误不会直接导致细胞死亡，但可以继续分裂，导致胚胎中一些细胞的染色体异常，即嵌合体；
3、激素水平紊乱：激素水平对胚胎有很大影响，一些女性因为体内有太多的激素可能会影响胚胎，破坏胚胎，从而导致胚胎嵌合体。
一般来说嵌合体胚胎多发生在第三代试管中，因为其自身的染色体异常，胚胎处理后，染色体在后期发育过程中仍然无法避免出现问题。一般来说如果胚胎的嵌合体比例高于80%，则为异常胚胎，无法移植。
